企业如果发生零申报逾期，是无法直接在电子税务局上直接补申报，需要企业办税人员携带营业执照、公章、财务报表、申报表、办税人员身份证等资料，去税务机关大厅补做相应税款的申报。如果是经常逾期的话，可能会有相应的罚款。
